More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1558 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 321 aa  613  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  62.73 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  51.62 
 
 		 304 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  57.1 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  52.15 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  50.77 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  48.48 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  55.56 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  51.97 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  49.83 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  46.51 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  45.87 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  49.16 
 
 		 272 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  48.4 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  47.08 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  45.28 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  43.1 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  48 
 
 		 278 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  48.17 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  46.71 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  41.53 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  46.67 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  47.08 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  45.12 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  45.92 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  45.7 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  44.79 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  41.77 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  44.75 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  44.75 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  45.37 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  44.55 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  42.54 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  45.19 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  41.23 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  32.01 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32.69 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  35.85 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  29.61 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  28.15 
 
 		 279 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  28.43 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  29.28 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  34.36 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  32.34 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  31.63 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  29.97 
 
 		 284 aa  99.4  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  34.82 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  29.87 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  26.94 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  32.21 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  27.16 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  38.54 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  29.25 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  30.42 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  33.02 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  27.95 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  29.58 
 
 		 259 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  32.66 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  31.12 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  32.69 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  28.43 
 
 		 269 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  31.97 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  31.35 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  26.69 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  29.1 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  30.56 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  31.15 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  31.15 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  30.77 
 
 		 407 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  29.35 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  34.32 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  32.32 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  31.15 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  31.15 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  30.25 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  30.1 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  28.95 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  28.95 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  25.93 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  28.29 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  32.19 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  26.64 
 
 		 286 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.49 
 
 		 277 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  32.69 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  29.04 
 
 		 276 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  29.1 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>