More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1049 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  56.95 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  50.49 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  51.48 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  48.68 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  49.02 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  46.67 
 
 		 280 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  48.48 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  47.56 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  46.49 
 
 		 268 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  49.2 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  47.18 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  49 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  45.73 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  45.54 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  45.92 
 
 		 270 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  45.61 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  44.3 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  43.96 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  44.26 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  42.39 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  42.19 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  44.52 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  42.04 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  41.14 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  37.69 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  41.69 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  42.57 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  39.74 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  39.74 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  38.46 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  33 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  36.61 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  28.16 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.76 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  27.88 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  32.69 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.68 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  31.15 
 
 		 279 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  28.3 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  33.54 
 
 		 368 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  31.89 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  28.94 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  28.94 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32.69 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  32.24 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  31.89 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  34.82 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  32.79 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  31.79 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  26.92 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  31.11 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  33.76 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  33.02 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  32.9 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  31.07 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  30.46 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  31.17 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  34.1 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  30.72 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  33.99 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  30.42 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  32.19 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>