More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1446 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  85.82 
 
 		 278 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  58.84 
 
 		 270 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  55.43 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  56.62 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  54.18 
 
 		 277 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  55.12 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  53.43 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  55.28 
 
 		 302 aa  234  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  50.32 
 
 		 319 aa  231  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  50.9 
 
 		 281 aa  221  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  48.48 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  50.53 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  46.67 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  47.64 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  47.64 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  47.78 
 
 		 289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  47.3 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  50.7 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  51.37 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  47.62 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  48.58 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  50.53 
 
 		 285 aa  201  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  50.9 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  46.08 
 
 		 289 aa  198  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  47.87 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  47.51 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  41.08 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  44.88 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  44.56 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  46.33 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  43.43 
 
 		 309 aa  171  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  45.96 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.57 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  34.81 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  43.65 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  31.88 
 
 		 293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  32.12 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  33.22 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  31.01 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.54 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  38.59 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  31.42 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  32.66 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  36.7 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  30.27 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  30.27 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  28.86 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  30.98 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.11 
 
 		 368 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  29.66 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  32.11 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  29.66 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  34.68 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  31.06 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  31.33 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  31.89 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  30.93 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>