More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4570 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  56.62 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  55.68 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  56.55 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  55.22 
 
 		 268 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  58.05 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  53.14 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  52.04 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  51.84 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  52.24 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  54.72 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  50.74 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  51.07 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  48.7 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  48.55 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  45.95 
 
 		 304 aa  201  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  44.15 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  45.61 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  46.43 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  45.96 
 
 		 302 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  44 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  45.77 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  45.77 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  45.77 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 303 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  48.76 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  47.48 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  43.23 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  44.78 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  45.12 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  39.46 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  39.5 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  36.55 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  44.19 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  35.49 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 276 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.4 
 
 		 279 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.64 
 
 		 355 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  32.78 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  36.47 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  34.58 
 
 		 407 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>