More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0218 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 266 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  66.79 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  65.02 
 
 		 272 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  59.54 
 
 		 270 aa  330  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  59.09 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  59.92 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  57.75 
 
 		 256 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  43.12 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  43.49 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  40.42 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  44.28 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  42.59 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  43.12 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  37.02 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  38.72 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  41.54 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  41.39 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  39.34 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  38.58 
 
 		 274 aa  158  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 277 aa  148  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  35.13 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  38.75 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 292 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 275 aa  141  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 276 aa  141  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  31.79 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.39 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  36.5 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3249  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 284 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  31.79 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  31.49 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  31.77 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  33.7 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  32.16 
 
 		 279 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 279 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  32.18 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  32.63 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  33.92 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  32.07 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  31.82 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  31.47 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0137  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  31.4 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>