More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0998 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  39.5 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.16 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  37.94 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  35.13 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 355 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  38.71 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  34.18 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  30.14 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 282 aa  141  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  32.73 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  33.33 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  34.77 
 
 		 280 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  36.63 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  34.27 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  33.92 
 
 		 281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3790  diaminopimelate epimerase  32.42 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  34.77 
 
 		 288 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  31.07 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  30.96 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  30.96 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  30.96 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  30.14 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  30.96 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 274 aa  128  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  31.79 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  34.2 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  32.5 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  32.33 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 288 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  29.08 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.06 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.39 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  30.25 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  30.25 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  32.01 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  29.89 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  29.89 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  32.36 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>