More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1165 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 277 aa  570  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  45.42 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  43.45 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  43.8 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  42.12 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  37.64 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  40.66 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  39.27 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  38.6 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  41.39 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  39.26 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  38.27 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  42.4 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  34.74 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  39.05 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  38.24 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  35.51 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  39.34 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  39.48 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 323 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 249 aa  145  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  37.82 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  36.05 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  37.82 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  34.26 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  34.25 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  34.26 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  35.53 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  34.46 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  34.11 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  36.93 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  34.38 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  34.38 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  32.39 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  33.92 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  39.11 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  32.39 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_002620  TC0714  diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  30.31 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  32.53 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 		 273 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  30.5 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  31.71 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  31.96 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>