More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3982 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  56.46 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  52.75 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  54.85 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  52.83 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  53.45 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  50.87 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  51.05 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  51.46 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  53.85 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  47.87 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  48.61 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  48.11 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  48.11 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  47.58 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  50.89 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  46.13 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  44.71 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  50.74 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  44.14 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  48.42 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  49.15 
 
 		 321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  46.71 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  44.26 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  42.04 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  45.74 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  37.25 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  41.28 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  37.15 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.12 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  31.9 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  31.9 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.34 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  35.9 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  31.41 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  31.9 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  28.67 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  31.9 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  31.45 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  34.18 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  32.61 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  25.69 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.77 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  36.26 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  33.96 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  30.91 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  30.68 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  30.39 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  32.84 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  32.12 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>