More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3961 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 289 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  78.82 
 
 		 289 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  74.31 
 
 		 289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  73.97 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  73.97 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  73.63 
 
 		 313 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  58.82 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  62.14 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  56.45 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  51.24 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  51.6 
 
 		 268 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  51.23 
 
 		 273 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  48.61 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  47.37 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  49.12 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  47.3 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  48.43 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  46.44 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  46.71 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  43.14 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  48.97 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  43.99 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  44.59 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  39.74 
 
 		 317 aa  158  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  39.75 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  41.78 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  40.72 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  41.98 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  40.45 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  43.51 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  38.46 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  39.05 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.05 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  28.38 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.04 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.35 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  32.24 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  32.4 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.21 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  29.9 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  29.9 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  30.72 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  28.04 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  28.04 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  26.57 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  27.46 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.88 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  30.33 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  26.69 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  32.59 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  26.76 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  30.17 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  28.9 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  26.09 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  29.05 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  30.33 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  31.65 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  30.33 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  28.16 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  29.78 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.43 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  30.67 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  30.17 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  27.52 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  27.55 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  31.85 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  31.48 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  28.1 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  30.63 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  29.2 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  31.02 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 279 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  29.79 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  30.14 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  30.14 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  30.14 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  30.46 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  30.14 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>