More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2235 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  74.81 
 
 		 270 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  63.81 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  57.72 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  56.41 
 
 		 271 aa  275  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  54.78 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  55.43 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  53.99 
 
 		 278 aa  258  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  54.89 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  55.04 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  52.83 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  52.31 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  50.9 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  54.78 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  54.48 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  50.53 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  45.7 
 
 		 303 aa  221  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  49.3 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  49.3 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  47.72 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  50.9 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  46.8 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  45.72 
 
 		 319 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  50.73 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  47.14 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  43.58 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  46 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  41.47 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  40.8 
 
 		 314 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  43.29 
 
 		 309 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  37.07 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  42.72 
 
 		 321 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.42 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  35.86 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  35.86 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.81 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  31.49 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  32.18 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  35.35 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 279 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32.53 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  32.36 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.25 
 
 		 279 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  34.68 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  34.83 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  34.14 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  31.94 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  32.41 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  28.77 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  31.62 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  34.8 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 279 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  32.53 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  32.66 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  33.92 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  31.53 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.34 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  32.08 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  34.13 
 
 		 291 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>