More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1501 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 319 aa  620  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  53.9 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  54.17 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  56.63 
 
 		 313 aa  271  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  52.58 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  56.81 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  55.27 
 
 		 309 aa  251  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  50.32 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  50.5 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  54.11 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  45.72 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  46.36 
 
 		 270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  49.68 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  48.84 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  46.3 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  43.23 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  44.3 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  43.65 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  44.06 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  39.94 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  42.72 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  43.98 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  45.54 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  41.57 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  38.48 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  38.53 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  38.53 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  39.56 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  39.75 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  37.27 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.34 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.95 
 
 		 278 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  30.06 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  33.12 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  33.12 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  32.9 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  31.37 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  33.77 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  27.96 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.89 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  29.77 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  30.6 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.59 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  29.01 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  31.09 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  29.87 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  31.61 
 
 		 279 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.18 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  32.69 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  32.36 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  31.01 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  28.03 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  27.88 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  28.94 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  28.71 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  38.37 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 272 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  30.97 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  25.95 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  30.19 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  26.06 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  30.46 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  31.71 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  30.45 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  30.55 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  28.48 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  29.28 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  27.39 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  29.32 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  30.36 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  27.92 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  27.92 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>