More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1483 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 303 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  50.34 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  49.83 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  50.69 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  46.39 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  46.98 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  47.06 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  45.05 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  48.33 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  48.82 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  46.26 
 
 		 277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  43.75 
 
 		 313 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  45.45 
 
 		 289 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  46.98 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  43.38 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  43.38 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  46.53 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  45.03 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  42.9 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  41.81 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  44.9 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  45.28 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  43.51 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  42.94 
 
 		 321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  39.75 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  40.33 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  38.44 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  42.06 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  40.72 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  37.26 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  36.68 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  37.95 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  33.97 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  30.65 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  28.48 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.23 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  33.86 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  32.69 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  30.55 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  39.33 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  28.66 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  31.75 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  32.15 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  33.12 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.96 
 
 		 279 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  31.37 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  28.99 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  30.52 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  31.37 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  30.43 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  30.26 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  27.83 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  27.83 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  27.83 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  32.26 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  27.51 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  32.19 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  32.26 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  32.11 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  27.92 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  30.19 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  30.6 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  31.94 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  27.94 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  30.84 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  32.52 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  29.45 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  30.91 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  30.45 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  31.17 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  31.61 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  32 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  29.97 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  27.05 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  31.41 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  30.97 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  31.01 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  30.65 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  32.26 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>