More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12739 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 289 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  79.58 
 
 		 289 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  75.17 
 
 		 293 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  75.17 
 
 		 293 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  75.35 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  74.31 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  59.25 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  62.68 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  54.45 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  55.75 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  54.64 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  52.31 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  51.05 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  54.2 
 
 		 273 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  50.52 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  50.17 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  48.42 
 
 		 271 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  47.75 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  50.69 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  48.62 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  50.68 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  45.69 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  45.13 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  41.56 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  39.69 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  37.27 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  31.53 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  28.72 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  36.39 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  33 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.23 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.77 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0407  diaminopimelate epimerase  30.61 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0431  diaminopimelate epimerase  30.27 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  31.31 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  31.74 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.24 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  32.06 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  26.78 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  30.17 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  32.59 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.11 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  28.18 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  27.89 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  30.96 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  28.18 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  34.64 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3160  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000134357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  26.94 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  30.56 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  29.77 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  30.16 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.34 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  34.72 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2337  diaminopimelate epimerase  27.66 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  31.08 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  31.89 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  27.89 
 
 		 274 aa  99.4  7e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  28.72 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  31.42 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  29.58 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  27.65 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  31.44 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  30.13 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  28.81 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  30.41 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  29.83 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3256  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.220746  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  25.75 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  27.93 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  31.79 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  29.9 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  31 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  29.56 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>