More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12773 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  56.98 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  51.92 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  50.19 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  52.49 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  51.71 
 
 		 259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  50.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  52.11 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  48.09 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  44.28 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  40.82 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  39.33 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  38.27 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  41.15 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 287 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  36.09 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  38.46 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  32.39 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 281 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 281 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  32.07 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  33.71 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  31.01 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  31.96 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  34.34 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  29.05 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 368 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  32.77 
 
 		 407 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  31.45 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  31.53 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  31.91 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  31.47 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  30.53 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  34.32 
 
 		 282 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  29.05 
 
 		 288 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  31.07 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  28.04 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  31.06 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  37.44 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  27.7 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  30.28 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  32.4 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  27.7 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  30.53 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  30.17 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  30.28 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  26.69 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  26.69 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  31.07 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  31.07 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  26.69 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  29.76 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  30.28 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>