More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1614 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 264 aa  543  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  62.02 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  54.65 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  56.03 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  55.43 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  51.92 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  49.03 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  45.17 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  43.87 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  38.72 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  36.56 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  37.31 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  38.22 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  35.88 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  36.26 
 
 		 282 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.51 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  32.4 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  29.66 
 
 		 286 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  31.1 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  31.01 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  29.31 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.74 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  32.74 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  30.66 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  30.48 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  29.58 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  31.47 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  36.41 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  30.53 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  36.19 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  30.9 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  34.43 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  30.34 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  30.9 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  30.9 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  31.45 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  30.9 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  31.85 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  32.58 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  29.35 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  31.16 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  31.34 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  31.1 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  31.34 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.16 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  30.21 
 
 		 387 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  32.16 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  29.69 
 
 		 355 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  30.56 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  29.43 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  29.15 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.23 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  30.21 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>