More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1873 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  57.62 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  56.13 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  57.93 
 
 		 282 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  54.55 
 
 		 279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  42.49 
 
 		 277 aa  215  8e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  42.12 
 
 		 277 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  39.85 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  40.67 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  38.15 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  36.47 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  37.22 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  34.83 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  40.53 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  38.66 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  36.5 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  37.13 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 		 247 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  40.5 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  34.21 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  33.71 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  37.18 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  36.76 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  34.87 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  33.98 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  36.53 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  32.77 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  34.91 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  33.94 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  40.16 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  34.55 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.77 
 
 		 368 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  36.13 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  34.4 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  34.84 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  34.91 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  33.91 
 
 		 407 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.91 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>