More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1466 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  82.48 
 
 		 314 aa  494  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  63.95 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  56.58 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  54.17 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 304 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  51.99 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  52.4 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  46 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  45 
 
 		 278 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  47.6 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  45.08 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  39.67 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  43.19 
 
 		 274 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  44.06 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  42.58 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  41.47 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  43.59 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  44.08 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  45.48 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  44.15 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 270 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  40.54 
 
 		 281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  41 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  42.33 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  40.53 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  37.38 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  38.64 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  37.03 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  37.03 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  39.23 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  37.03 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  36.91 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.65 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  34.09 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 283 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.47 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.35 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  32.35 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  34.97 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.49 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  30.32 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  31.42 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  30.59 
 
 		 279 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  34.2 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  29.7 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  32.9 
 
 		 355 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  32.54 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  29.47 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  30.67 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  33.65 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  30.42 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  29.67 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  29.67 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  29.67 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  29.67 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  33 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  29.7 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  33.87 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  30.07 
 
 		 264 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.25 
 
 		 279 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  29.37 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  30.55 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  33.87 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  30.72 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  32.79 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  30.79 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>