More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0050 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  88.68 
 
 		 267 aa  499  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1208  diaminopimelate epimerase  56.54 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  47.21 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  44.66 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  40.98 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  42.8 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  36.74 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  39.7 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  38.15 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  36.98 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  38.77 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  38.77 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  39.48 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  36.6 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  35.51 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0095  diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  38.32 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 282 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 279 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  38.71 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  31.85 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  31.85 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  38.35 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  31.85 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  36.5 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  36.63 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  37.96 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  33.95 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 279 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  34.3 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  36.94 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  34.91 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  37.74 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  36.63 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.77 
 
 		 292 aa  175  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  35.9 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  37.96 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  32.6 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  35.9 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  34.8 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  34.33 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  32.5 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 288 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 288 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.81 
 
 		 277 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  32.49 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  34.05 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>