More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5260 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  94.4 
 
 		 269 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0095  diaminopimelate epimerase  78.36 
 
 		 266 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  50.76 
 
 		 281 aa  261  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  46.97 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  48.86 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  48.11 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  47.35 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  48.88 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  45.52 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  42.53 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  32.59 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  31.85 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  39.26 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.05 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  38.71 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 274 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  37.87 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.96 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  37.18 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 289 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  36.56 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1208  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 263 aa  162  8.000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  36.96 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 293 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 290 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5499  diaminopimelate epimerase  36.96 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 280 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0205  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.834964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4011  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  35.42 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  34.7 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0541  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  35.42 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  35.99 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>