More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3391 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  75.26 
 
 		 303 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  75.26 
 
 		 303 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  78.28 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  71.33 
 
 		 301 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  69.97 
 
 		 301 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  73.48 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  66.78 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  62.11 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  60.92 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  61.11 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  61.11 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  62.09 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  59.72 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  58.89 
 
 		 288 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  55.87 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  55.56 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  55.75 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  53.45 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  55.4 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  54.86 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  52.48 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 290 aa  265  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  48.4 
 
 		 297 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  46.1 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  43.27 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  43.12 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  44.32 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  38.67 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  39.31 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  39.07 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  35.51 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  40.38 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 279 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  35.92 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.15 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.11 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  38.04 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  33.77 
 
 		 288 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 282 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  35.86 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  35.4 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.05 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>