More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0019 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 282 aa  589  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  52.48 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  52.28 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  48.78 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  48.08 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  46.52 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  44.69 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  45.36 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  44.67 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  45 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  43.57 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  44.8 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  42.39 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  43.27 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  43.36 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  45.36 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  40.44 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  41.35 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 275 aa  194  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  40.74 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  42.38 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  38.29 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  42.38 
 
 		 267 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  38.66 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  39.41 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  40.3 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  35.52 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  36.99 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  40.37 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  39.63 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  40.82 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  38.15 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.46 
 
 		 334 aa  165  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  34.94 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  34.83 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 304 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  38.83 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  39.26 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  34.81 
 
 		 287 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>