More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0523 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  58.03 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  49.08 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  47.43 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  48.76 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  50.74 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  47.89 
 
 		 293 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  48.73 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  47.26 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  46.32 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0095  diaminopimelate epimerase  44.49 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  48.15 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  45.82 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  51.28 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  44.41 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  44.41 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  45.68 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  39.24 
 
 		 295 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  44.84 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  45.85 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  44.52 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  44.84 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  42.28 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  42.01 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  42.2 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  41.72 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  45.73 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  42.71 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  44.3 
 
 		 315 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  45.05 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  39.3 
 
 		 279 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  38.81 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  41.37 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  44.37 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  38.46 
 
 		 281 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  44.37 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  42.67 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  43.57 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  40.77 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 387 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  41.7 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  39.51 
 
 		 281 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  44.53 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 282 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  40.66 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  41.03 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  41.39 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>