More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2595 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 278 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  97.1 
 
 		 276 aa  517  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  87.41 
 
 		 278 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  59.12 
 
 		 281 aa  327  9e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  57.35 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  55.56 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  57.3 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  52.77 
 
 		 277 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  49.24 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  50.74 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  48.86 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  48.86 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0095  diaminopimelate epimerase  47.89 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  48.39 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  50.38 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  48.34 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  36.98 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  47.17 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  42.6 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  41.5 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 279 aa  199  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  45.73 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  42.12 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  39.27 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  46.74 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  47.13 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  44.95 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  45.1 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  44.25 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  44.41 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  41.94 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  39.05 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  38.69 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 292 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  37 
 
 		 278 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  39.07 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 286 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  41.37 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  41.09 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  44.37 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  39.21 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  178  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  41.2 
 
 		 287 aa  178  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  39.27 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  41.05 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  38.04 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  39.19 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>