More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3656 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  86.69 
 
 		 293 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  72.35 
 
 		 296 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  72.01 
 
 		 296 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  71.53 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  74.06 
 
 		 296 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  62.84 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  61.9 
 
 		 288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  62.37 
 
 		 293 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  61.56 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  60.34 
 
 		 297 aa  315  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  61.3 
 
 		 293 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  56.08 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  58.98 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  59.18 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  56.27 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  56.27 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  55.4 
 
 		 293 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  55.99 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  58.42 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  55.28 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  56.52 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  54.23 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  53.92 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  52.51 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  48.45 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  48.42 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  46.1 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  43.49 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  45.67 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  42.55 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  44.09 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  47.04 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  45.1 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  44.52 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  41.99 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  40.89 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  37.81 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  43.75 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  36.22 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  37.89 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  39.07 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  40.43 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 279 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 274 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 274 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 274 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 274 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 274 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  38.27 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  46.24 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  38.21 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1208  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  33.77 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  39.07 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>