More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4071 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  96.68 
 
 		 301 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  77.33 
 
 		 303 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  76.68 
 
 		 292 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  71.33 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  70.31 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  70.31 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  71.33 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  58.36 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  58.36 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  56.84 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  57.3 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  56.55 
 
 		 293 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  57.65 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  55.79 
 
 		 288 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  57.39 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  54.27 
 
 		 296 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  54.64 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  55.99 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  52.61 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  54.64 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  48.92 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  46.85 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  48.08 
 
 		 282 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  47.74 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  43.36 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  43.51 
 
 		 277 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 280 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  40.99 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  40.85 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  44.68 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  40.52 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  39.51 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  36.21 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  37.67 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  36.99 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  36.33 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  38.73 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  32.52 
 
 		 277 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.33 
 
 		 279 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  31.99 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  33.67 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  32.54 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  34.27 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  34.24 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  30.9 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 387 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  34.23 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  32.07 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  34.12 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.15 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>