More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4868 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  49.3 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  47.75 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  48.59 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  46.55 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  48.77 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  48.24 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  48.06 
 
 		 280 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  47.26 
 
 		 279 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 277 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  48.29 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  47.72 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  47.75 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  47.37 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  48.45 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  48.78 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  46.28 
 
 		 296 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  45.05 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  46.89 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 301 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  45.61 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  45.61 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  45.64 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  44.41 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  45.1 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  38.27 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  41.4 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  41.43 
 
 		 281 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  44.56 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  37.18 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  41.4 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  38.72 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  40.67 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  37.81 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  36.99 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  39.5 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  41.7 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 275 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  39.46 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  40.96 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 269 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 269 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  37.04 
 
 		 279 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.12 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  38.94 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  38.6 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 280 aa  178  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  38.95 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  39.4 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>