More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1859 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  87.79 
 
 		 300 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  75.26 
 
 		 293 aa  427  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  70.31 
 
 		 301 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  69.77 
 
 		 301 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  72.5 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  67.46 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  59.35 
 
 		 290 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  58.99 
 
 		 297 aa  331  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  57.14 
 
 		 293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  56.83 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  57.04 
 
 		 289 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  57.76 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  56.34 
 
 		 293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  56.38 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  56.38 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  56.27 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  55.91 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  51.77 
 
 		 325 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  54.96 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  48.91 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  50.53 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  47.87 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  44.68 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  43.32 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  41.09 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 267 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 		 267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  42.26 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 278 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 275 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 278 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  36.5 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  37.96 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  34.4 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  37.11 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  37.11 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  37.11 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  37.82 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  37.96 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  36.21 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>