More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0054 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  65.46 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  65.06 
 
 		 249 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  64.66 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  52.46 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  53.69 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  52.36 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  52.03 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  53.66 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  48.5 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  37.33 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  39.11 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  38.36 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  31.42 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  38.32 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  33.84 
 
 		 279 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  34.2 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  38.76 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  37.62 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  30.53 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  30.32 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  31.35 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  32.17 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  29.92 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  36.51 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  36.51 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  33.06 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  34.73 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 232 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  32.84 
 
 		 283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  33.47 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  34.7 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  27.64 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.14 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  27.7 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  31 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  31.84 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  28.36 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  28.78 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  30.61 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  27.7 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  31.88 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  27.9 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  31.71 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  29.6 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  28.93 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  29.39 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  31.84 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  33.98 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  29.78 
 
 		 278 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  27.14 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  29.52 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 288 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  27.86 
 
 		 281 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  30.84 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  31.82 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  29.86 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  27.86 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  32.1 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  32 
 
 		 284 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  28.73 
 
 		 278 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  27.4 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  28.45 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  27.93 
 
 		 334 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  30.67 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  28.51 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.33 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  28.63 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  26.84 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  25.98 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  27.05 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  25.98 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  25.98 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>