More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1874 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  43.7 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  42.13 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  42.13 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  39.06 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  35.86 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 287 aa  121  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  34.82 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  32.93 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  37.6 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  33.63 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  29.96 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  40.72 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  34.23 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  36.64 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 249 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  34.14 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  32.05 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  35.83 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  33.48 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  30.86 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  34.24 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  36.5 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  32.91 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  33.89 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  30.3 
 
 		 268 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  33.17 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  34.1 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  31.34 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  37.21 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  32.94 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  32.55 
 
 		 286 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0714  diaminopimelate epimerase  29.84 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  30.48 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  31.5 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  30.47 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 		 281 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  29.5 
 
 		 284 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  30.99 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  29.52 
 
 		 284 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  28.97 
 
 		 282 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  32.3 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  29.28 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31 
 
 		 286 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  27.21 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  26.94 
 
 		 286 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 278 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.32 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 		 277 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  28.69 
 
 		 283 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.15 
 
 		 281 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  28.77 
 
 		 282 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  27.86 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  28.73 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  30.6 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  31.92 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  27.76 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  29.39 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  28.63 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  31.13 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  26.45 
 
 		 315 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  28.36 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  27.99 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  28.29 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  27.31 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  29.7 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  29.55 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  29.06 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  26.45 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  28.95 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  28.87 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  28.4 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  27.01 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  28.79 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  26.42 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>