More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2046 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 257 aa  532  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  59.6 
 
 		 247 aa  314  7e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  57.03 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  54.69 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  53.38 
 
 		 272 aa  258  6e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  51.76 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  50.79 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  51.18 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  50.2 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  52.36 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  53.75 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  37.82 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  35.85 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  36.41 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  34.06 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  35.4 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 281 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  32.53 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  34.87 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  32.85 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  31.88 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  30.6 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  35.68 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  34.96 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  35.98 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  31.02 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  30.56 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  31.2 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  29.67 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  31.39 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  31.03 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  31.03 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  30.69 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  33.33 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  30.26 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  31.52 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.04 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  33.07 
 
 		 278 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  34.43 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  29.82 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  34.43 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.12 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  29.37 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  33.63 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  29.59 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  27.08 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  32.72 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  29.37 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  30.53 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  30.5 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  28.82 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  28.92 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  29.8 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  32.91 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  33.05 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  32.66 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  30.18 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  29.82 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  26.92 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  28.67 
 
 		 286 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  32.23 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  29.35 
 
 		 287 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  28.81 
 
 		 315 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  32.08 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  28.81 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.05 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  32.05 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  27.14 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  28.35 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 282 aa  92  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  30.21 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  26.6 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  27.34 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  31.62 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.96 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  27.02 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  27.82 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>