152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0511 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  100 
 
 		 412 aa  835    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  69.01 
 
 		 413 aa  614  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  73.06 
 
 		 412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  66.75 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  39.55 
 
 		 443 aa  273  3e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  35.94 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  33.26 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  28.64 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.78 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  30.24 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  29.48 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  28.93 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  30.18 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  29.52 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  29.52 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.64 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.7 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.57 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.34 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  30.41 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.64 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.75 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  27.35 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  28.7 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  27.81 
 
 		 439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.57 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  30.41 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  28.61 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  28.68 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.54 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.09 
 
 		 480 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.88 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  27.05 
 
 		 863 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.64 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.83 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  26.04 
 
 		 652 aa  109  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.04 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  26.51 
 
 		 680 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.2 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  25.5 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  24.14 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  25.06 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  24.63 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.64 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  25.58 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  24.94 
 
 		 338 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  32.95 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  23.59 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  32.95 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  26.23 
 
 		 745 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  25.24 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  20.64 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  26.93 
 
 		 656 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  24.39 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  24.62 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.88 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  32.57 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  24.04 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  32.3 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  31.95 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.43 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  32.08 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.21 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0828  tRNA pseudouridine synthase D  24.4 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.218757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  23.4 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.83 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  32.39 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  23.2 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  28.99 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  24.25 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  27.83 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.99 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  23.74 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0967  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  30.29 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  31.87 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02595  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2870  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3996  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1984  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  25.12 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100615 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  29.31 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3046  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.538175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02560  hypothetical protein  30.06 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.81 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  23.57 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.81 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.81 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.81 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.06 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  24.26 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.12 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  29.82 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  23.29 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  29.76 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  23.29 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  26.47 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  23.29 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  24.54 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.58 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>