147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1474 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  76.67 
 
 		 480 aa  716    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  100 
 
 		 454 aa  909    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  65.49 
 
 		 452 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  67.11 
 
 		 449 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  58.59 
 
 		 483 aa  521  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  41.2 
 
 		 439 aa  328  8e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  40.43 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  42.11 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  35.14 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.77 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.67 
 
 		 410 aa  239  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  35.36 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  32.75 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  30.97 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.75 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  32.61 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  29.93 
 
 		 413 aa  163  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  31.57 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.86 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.51 
 
 		 390 aa  153  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.13 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  27.21 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  29.17 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  30.82 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.48 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.19 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.54 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  27.53 
 
 		 412 aa  143  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.65 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.13 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.11 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  26.55 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  26.82 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  25.93 
 
 		 680 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  30.16 
 
 		 652 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  25.52 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.77 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  25.51 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  25.52 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.33 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  28.03 
 
 		 863 aa  93.6  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  23.65 
 
 		 389 aa  93.2  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  29.32 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  22.68 
 
 		 399 aa  90.1  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  26.42 
 
 		 354 aa  87.8  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  25.55 
 
 		 386 aa  87.4  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  36.05 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.05 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.17 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.6 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  31.35 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  26.62 
 
 		 745 aa  77  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  26.56 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  30.81 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  25.28 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.11 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  25.82 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  23.61 
 
 		 656 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.89 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  28.93 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  28.57 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  29.35 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  36.9 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.2 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  31.43 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.83 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.77 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.54 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  27.2 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  24.82 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  33.58 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.61 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  32.39 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1513  tRNA pseudouridine synthase D  36.57 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.89 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17440  tRNA pseudouridine synthase D  36.57 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  31.89 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  34.56 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3346  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.51 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00141322  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.19 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.42 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  28.65 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3508  tRNA pseudouridine synthase D  32.62 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  32.19 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  31.69 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  31.69 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  31.69 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  33.08 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0838  tRNA pseudouridine synthase D  31.72 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.01 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3351  tRNA pseudouridine synthase D  31.21 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  28.67 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  28.87 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0967  tRNA pseudouridine synthase D  28.87 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3129  tRNA pseudouridine synthase D  28.87 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02595  tRNA pseudouridine synthase D  28.87 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.87 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1249  pseudouridylate synthase  30.14 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883014  normal  0.601505 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02560  hypothetical protein  28.87 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0828  tRNA pseudouridine synthase D  26.76 
 
 		 348 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.218757 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>