153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0803 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  886    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  52.01 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  49.76 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  49.17 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  40.91 
 
 		 422 aa  335  9e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  37.7 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  38.66 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  34.78 
 
 		 438 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  34.21 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.08 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  32.53 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.75 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  31.08 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.3 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.43 
 
 		 443 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  32.48 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  27.73 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  29.95 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.77 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.38 
 
 		 430 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  28.85 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.45 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  30.43 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.4 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  28.95 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  29.29 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.51 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.99 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  30.12 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  30.24 
 
 		 652 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.91 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.27 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  28.97 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  26.73 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  32.94 
 
 		 680 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  24.82 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  26.87 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  25 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  24.45 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  26.39 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.68 
 
 		 377 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.46 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  29.66 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  30.26 
 
 		 745 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.98 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  37.2 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  35 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  35.62 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.34 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.11 
 
 		 455 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  24.16 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.5 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.4 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.66 
 
 		 359 aa  96.3  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  35 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.11 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.8 
 
 		 345 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  31.93 
 
 		 656 aa  93.6  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  36.08 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.51 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  28.57 
 
 		 863 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  24 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  30.38 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  35 
 
 		 343 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.99 
 
 		 349 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  31.65 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  30.34 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  29.48 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  33.33 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  33.13 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  32.72 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  32.72 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.9 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.18 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  32.72 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  32.1 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  35.26 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.15 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.29 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.29 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  31.29 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.29 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.29 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  31.29 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  31.45 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  34.21 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.48 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  29.07 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  31.48 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  29.63 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  29.48 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  32.1 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  28.9 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3346  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.86 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00141322  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1340  pseudouridylate synthase  41.18 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.185288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1249  pseudouridylate synthase  31.71 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883014  normal  0.601505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  30.64 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1200  pseudouridylate synthase  30.86 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00296391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  33.99 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>