144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46601 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  100 
 
 		 680 aa  1399    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  34.31 
 
 		 745 aa  356  7.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  31.54 
 
 		 652 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  34.61 
 
 		 863 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  27.67 
 
 		 656 aa  233  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  30.84 
 
 		 439 aa  127  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  32.15 
 
 		 433 aa  127  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.43 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  27.15 
 
 		 438 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  32.94 
 
 		 422 aa  122  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  32.41 
 
 		 423 aa  117  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  31.72 
 
 		 422 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.56 
 
 		 422 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.93 
 
 		 454 aa  111  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.89 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  25.97 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  25.44 
 
 		 449 aa  105  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  26.07 
 
 		 423 aa  104  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  27.23 
 
 		 411 aa  103  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  29.81 
 
 		 390 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.43 
 
 		 430 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  27.41 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  27.03 
 
 		 412 aa  99.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.81 
 
 		 430 aa  98.2  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  26.93 
 
 		 413 aa  97.4  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.18 
 
 		 390 aa  95.1  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  25.36 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.87 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  26.94 
 
 		 399 aa  87  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  25.34 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  28.63 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.09 
 
 		 402 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  28.93 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.34 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  28.14 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.69 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.39 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  27.4 
 
 		 389 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.48 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  31.06 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  23.53 
 
 		 408 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  30.2 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  32.87 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  36.64 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  26.62 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.4 
 
 		 455 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  32.82 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.24 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  27.68 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  27.84 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3351  tRNA pseudouridine synthase D  34.4 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.73 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  22.84 
 
 		 457 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1984  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.74 
 
 		 389 aa  67  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.61 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  35.2 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  23.37 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3508  tRNA pseudouridine synthase D  33.6 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0838  tRNA pseudouridine synthase D  32.52 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  34.35 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  28.15 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  38.46 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.92 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  29.13 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  33.87 
 
 		 375 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  33.87 
 
 		 375 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  32.8 
 
 		 375 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  34.13 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.34 
 
 		 395 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.43 
 
 		 354 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.56 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  34.68 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  30.07 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  32.54 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.54 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.54 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1340  pseudouridylate synthase  27.54 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.185288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.54 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.54 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  29.6 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3346  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.65 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00141322  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0674  pseudouridylate synthase  31.08 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.305737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1696  hypothetical protein  26.32 
 
 		 403 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  29.19 
 
 		 338 aa  57  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  32.26 
 
 		 360 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  30.95 
 
 		 365 aa  57  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  36 
 
 		 356 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  27.97 
 
 		 347 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  32.53 
 
 		 354 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1200  pseudouridylate synthase  36 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00296391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  30.4 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  30.22 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  27.69 
 
 		 367 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  33.06 
 
 		 370 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.57 
 
 		 354 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.62 
 
 		 362 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  32.26 
 
 		 338 aa  55.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  32.62 
 
 		 362 aa  55.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>