152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1378 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  86.01 
 
 		 457 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  80.41 
 
 		 455 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  80.88 
 
 		 455 aa  709    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  100 
 
 		 455 aa  915    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  31.19 
 
 		 399 aa  219  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  30.46 
 
 		 389 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  27.74 
 
 		 389 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  28.06 
 
 		 389 aa  206  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  27.74 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.66 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  29.27 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.32 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.9 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  27.86 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  27.56 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.04 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  29.17 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  26.72 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  26.76 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  24.57 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  25.32 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  24.34 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  26.46 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.76 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  25.57 
 
 		 399 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  24 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.06 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.63 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.96 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  26.13 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.17 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  33.56 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  33.56 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.05 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.16 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  24.47 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  26.08 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.67 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.45 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.45 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  25.7 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.19 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.47 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.19 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  23.28 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  30.63 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  26.12 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  25.46 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  26.35 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  25.44 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.14 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  22.38 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.89 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.68 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  28.66 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  24.59 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  32.45 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1148  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.68 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.68 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  24.81 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  32.68 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  25.06 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  20.15 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1200  pseudouridylate synthase  30.87 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00296391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  24.42 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  28.76 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.67 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38720  tRNA pseudouridine synthase D  32.93 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  30 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  29.48 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1984  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.7 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1619  tRNA pseudouridine synthase D  32.28 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1128  tRNA pseudouridine synthase D  31.29 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1249  pseudouridylate synthase  30.72 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883014  normal  0.601505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  29.48 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  23.84 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  25.87 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  28.67 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  33.12 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4158  tRNA pseudouridine synthase D  32.28 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  32.89 
 
 		 359 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1303  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.49 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  28.1 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1173  tRNA pseudouridine synthase D  31.65 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  25.17 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1513  tRNA pseudouridine synthase D  31.69 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  28.38 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  24.01 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.28 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  29.87 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17440  tRNA pseudouridine synthase D  31.69 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1370  tRNA pseudouridine synthase D  33.56 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  30.87 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  25.85 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  32.24 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0674  pseudouridylate synthase  28.14 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.305737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  32.24 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  27.33 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1340  pseudouridylate synthase  23.27 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.185288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>