152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0906 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  100 
 
 		 423 aa  869    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  59.67 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  55.53 
 
 		 422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  49.76 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  45.75 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  37.61 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  36.67 
 
 		 439 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  40.19 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  36.44 
 
 		 452 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.36 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  35.25 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.03 
 
 		 480 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.98 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  33.2 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  33.41 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.26 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  32.6 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  32.35 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.05 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.8 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.37 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  28.67 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  31.45 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.66 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  30.32 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  30.5 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.4 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.43 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  30.71 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.1 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  28.47 
 
 		 652 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  29.93 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.93 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  26.38 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.56 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  32.41 
 
 		 680 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.43 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  31.72 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  29.81 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.17 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  29.81 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.79 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  30.68 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.79 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.41 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  26.78 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  27.79 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  37.36 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.85 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  38.69 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  31.49 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  33.33 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  29.78 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  36.2 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.38 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  25.13 
 
 		 863 aa  90.5  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  28.1 
 
 		 745 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.77 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  37.79 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  36.65 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  30.98 
 
 		 656 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  34.52 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  26.89 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.91 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1249  pseudouridylate synthase  29.63 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883014  normal  0.601505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  31.71 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  34.15 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  31.06 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  31.1 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.55 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  33.74 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  33.74 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  33.74 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0838  tRNA pseudouridine synthase D  32.93 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  32.52 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.7 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  31.37 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  31.1 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  33.13 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  31.93 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  30 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.76 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  34.19 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  28.63 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02595  tRNA pseudouridine synthase D  29.09 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2870  tRNA pseudouridine synthase D  29.09 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  31.33 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  32.1 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02560  hypothetical protein  29.09 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3996  tRNA pseudouridine synthase D  29.09 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3134  tRNA pseudouridine synthase D  24.88 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0800342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3046  tRNA pseudouridine synthase D  29.09 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.538175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  33.13 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  33.54 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  30.14 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  31.29 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  29.38 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  29.09 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  30.82 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>