153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1281 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  100 
 
 		 439 aa  898    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  61.33 
 
 		 438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  48 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  40.42 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  41.2 
 
 		 454 aa  328  8e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  39.52 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  40.09 
 
 		 449 aa  317  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  39.03 
 
 		 423 aa  299  6e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  35.46 
 
 		 483 aa  295  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  36.49 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  37.7 
 
 		 422 aa  285  9e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  36.67 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  39.17 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  37.59 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.95 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  32.18 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  33.78 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.79 
 
 		 390 aa  203  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.59 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.81 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  30.31 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  26.94 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.64 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  28.17 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.27 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.19 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.42 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  27.96 
 
 		 652 aa  142  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  27.59 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  28.13 
 
 		 863 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  26.71 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  25.23 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  25.34 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  30.84 
 
 		 680 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  27.97 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.63 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  31.38 
 
 		 745 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.77 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.25 
 
 		 455 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  26.01 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.43 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.01 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.45 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  27 
 
 		 347 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  25.48 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  25.12 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  25.48 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  25.9 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.35 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  32.93 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.38 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  30.25 
 
 		 656 aa  99.8  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.54 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  35.15 
 
 		 350 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  23.79 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.53 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  33.12 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.26 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1971  pseudouridylate synthase  24.41 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1696  hypothetical protein  25.06 
 
 		 403 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  34.38 
 
 		 343 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.97 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  36.49 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  35.81 
 
 		 338 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  36.59 
 
 		 357 aa  87  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  35.85 
 
 		 349 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  34.55 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1249  pseudouridylate synthase  33 
 
 		 329 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883014  normal  0.601505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3134  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0800342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  34.59 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0674  pseudouridylate synthase  35.06 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.305737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  36.14 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  31.87 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  21.22 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1303  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.36 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  34.42 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  33.73 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  34.19 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0967  tRNA pseudouridine synthase D  32.32 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.71 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1148  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.94 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  33.73 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  32.32 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  32.34 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  29.74 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.74 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02595  tRNA pseudouridine synthase D  32.32 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2870  tRNA pseudouridine synthase D  32.32 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3996  tRNA pseudouridine synthase D  32.32 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  31.1 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02560  hypothetical protein  32.32 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3046  tRNA pseudouridine synthase D  32.32 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.538175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.32 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>