149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0528 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  100 
 
 		 385 aa  782    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.99 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  38.72 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.26 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  25.89 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  24.63 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  26.52 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.46 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.06 
 
 		 457 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  25.13 
 
 		 389 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.06 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.06 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  24.21 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  29.98 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  27.94 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  26.98 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  26.86 
 
 		 433 aa  99.8  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  26.11 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.12 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  27.32 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  24.26 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  26.7 
 
 		 412 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  24.32 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  27.86 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  31.32 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  25.62 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.01 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  26.95 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.23 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.81 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  31.02 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.07 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  29.69 
 
 		 680 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3508  tRNA pseudouridine synthase D  36.42 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  27.63 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  37.84 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  26.73 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  25.78 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  36 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  37.84 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  25.85 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  27.65 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4158  tRNA pseudouridine synthase D  41.83 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  27.12 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1619  tRNA pseudouridine synthase D  41.83 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.79 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  32.4 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  31.18 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  30.54 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3351  tRNA pseudouridine synthase D  36.77 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1173  tRNA pseudouridine synthase D  40.52 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  31.18 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  31.18 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  31.18 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0838  tRNA pseudouridine synthase D  35.76 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  34.42 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.19 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1370  tRNA pseudouridine synthase D  27.34 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  27.85 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.59 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1561  hypothetical protein  28.31 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1499  tRNA pseudouridine synthase D  31.79 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1128  tRNA pseudouridine synthase D  31.13 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  29.25 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  35.9 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  32.03 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  33.56 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  25.48 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3129  tRNA pseudouridine synthase D  30.22 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  29.61 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  28.24 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  31.55 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1148  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.45 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.58 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  22.52 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  29.41 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  27.76 
 
 		 863 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  37.41 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  31.54 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  29.61 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  29.61 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  29.61 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  34.21 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.11 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  29.61 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.82 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  22.67 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  25.7 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0828  tRNA pseudouridine synthase D  35.1 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.218757 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.01 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1200  pseudouridylate synthase  31.76 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00296391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.64 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38720  tRNA pseudouridine synthase D  40.67 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  33.12 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.01 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.49 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.56 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3996  tRNA pseudouridine synthase D  29.67 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2870  tRNA pseudouridine synthase D  29.67 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>