153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0760 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  818    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  54.45 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  51.64 
 
 		 399 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  50.13 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  48.49 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  48.35 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  47.24 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  37.28 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  37.53 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  36.52 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  38.82 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.59 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.33 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  33.97 
 
 		 433 aa  195  9e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  30.31 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  32.62 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  32.19 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  32.45 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.59 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  29.93 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  31.78 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.85 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.57 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  29.93 
 
 		 357 aa  159  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  31.9 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  29.95 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.21 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.42 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  30.12 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  43.5 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  29.17 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.37 
 
 		 480 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.71 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  31.16 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  27.32 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.07 
 
 		 430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  30.48 
 
 		 347 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  31.13 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  27.08 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  29.37 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.82 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  31.51 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  31.39 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  28.53 
 
 		 374 aa  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  45.76 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.99 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  29.18 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.8 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  27.48 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1513  tRNA pseudouridine synthase D  32.82 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  27.79 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  31.31 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17440  tRNA pseudouridine synthase D  32.82 
 
 		 355 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  28.98 
 
 		 411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  28.61 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  31.08 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  31.71 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1128  tRNA pseudouridine synthase D  30.21 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  28.46 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  28.12 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1561  hypothetical protein  31.03 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3025  tRNA pseudouridine synthase D  32.22 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  30.63 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1370  tRNA pseudouridine synthase D  32.23 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  30.98 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  30.98 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  25.44 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  30.98 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  26.34 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  28.75 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.5 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.5 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.5 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  26.48 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.5 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.54 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  29.19 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3351  tRNA pseudouridine synthase D  30.65 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2636  pseudouridylate synthase  30.4 
 
 		 348 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  28.46 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  28.93 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  29.4 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  26.63 
 
 		 375 aa  126  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  29.4 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.75 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  29.4 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  29.4 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  29.75 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3134  tRNA pseudouridine synthase D  29.4 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0800342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3508  tRNA pseudouridine synthase D  29.87 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  28.72 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  28.3 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1984  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  27.36 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100615 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  28.26 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  28.72 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.46 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  25.5 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  38.37 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2870  tRNA pseudouridine synthase D  29.31 
 
 		 349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>