149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2665 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  100 
 
 		 452 aa  912    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  65.49 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  65.49 
 
 		 449 aa  588  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  61.17 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  57.97 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  39.52 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  39.7 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  41.31 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  37.67 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  36.44 
 
 		 423 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  34.21 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.26 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  32.6 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.55 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.83 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  32.68 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  30.18 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  31.47 
 
 		 413 aa  163  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.6 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  26.67 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  30.77 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.38 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.22 
 
 		 399 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  28.96 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  28.91 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  29.68 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.37 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  27.48 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.85 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.43 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.69 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.88 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  25.06 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  30.43 
 
 		 652 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  25.97 
 
 		 680 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  30.7 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.73 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  23.13 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  22.58 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  25.06 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  23.97 
 
 		 389 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.41 
 
 		 349 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  21.4 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.57 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  28.13 
 
 		 863 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  26.54 
 
 		 365 aa  90.5  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.23 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  24.48 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  24.37 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  27.12 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  23.19 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  25.45 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.26 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  25.51 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.73 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  29.51 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.55 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  25.42 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  35.67 
 
 		 354 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.7 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  32.12 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  29.71 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  29.51 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.51 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  30.81 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  26 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.15 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  29.51 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  29.72 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  31.58 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  30.99 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0967  tRNA pseudouridine synthase D  30.99 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.77182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.33 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1340  pseudouridylate synthase  33.06 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.185288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3346  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.02 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00141322  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0838  tRNA pseudouridine synthase D  35.46 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0674  pseudouridylate synthase  30.23 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.305737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  31.18 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02595  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3996  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  30.12 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  21.65 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3046  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.538175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3129  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2870  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  27.47 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  31.98 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  31.98 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  31.98 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  28.4 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  28.02 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1370  tRNA pseudouridine synthase D  32.87 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0828  tRNA pseudouridine synthase D  31.4 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.218757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  31.43 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3134  tRNA pseudouridine synthase D  31.43 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0800342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  31.43 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  31.43 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  31.43 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>