119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00984 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  100 
 
 		 745 aa  1538    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  34.02 
 
 		 680 aa  352  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  31.59 
 
 		 863 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  30.71 
 
 		 652 aa  228  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  27.46 
 
 		 656 aa  174  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  31.03 
 
 		 439 aa  125  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.76 
 
 		 402 aa  122  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  33.22 
 
 		 433 aa  121  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  28.61 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  30.55 
 
 		 422 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.12 
 
 		 430 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  30.26 
 
 		 422 aa  104  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  27.24 
 
 		 390 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28 
 
 		 390 aa  103  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  29.55 
 
 		 400 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.3 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.1 
 
 		 422 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  29.2 
 
 		 423 aa  97.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.12 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.8 
 
 		 443 aa  92  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  28.1 
 
 		 423 aa  89  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.63 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  27.3 
 
 		 399 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.66 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  23.94 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  27.65 
 
 		 449 aa  80.5  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.01 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  26.21 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  25.63 
 
 		 408 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  24.36 
 
 		 398 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.62 
 
 		 454 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  25.93 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  26.44 
 
 		 411 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.52 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  27.27 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  27.3 
 
 		 413 aa  70.1  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  25.42 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.48 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  22.61 
 
 		 398 aa  62  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  26.06 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  29.59 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0967  tRNA pseudouridine synthase D  29.59 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  28.87 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  28.99 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02595  tRNA pseudouridine synthase D  29.59 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02560  hypothetical protein  29.59 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  22.38 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3046  tRNA pseudouridine synthase D  29.59 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.538175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2870  tRNA pseudouridine synthase D  29.59 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3996  tRNA pseudouridine synthase D  29.59 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.59 
 
 		 349 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  28.47 
 
 		 403 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3134  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0800342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3129  tRNA pseudouridine synthase D  29.59 
 
 		 349 aa  56.6  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  22.63 
 
 		 389 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1971  pseudouridylate synthase  28.38 
 
 		 391 aa  55.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.69 
 
 		 355 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  55.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  55.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  25.89 
 
 		 377 aa  54.7  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  30.77 
 
 		 349 aa  54.7  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  21.09 
 
 		 399 aa  54.7  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  31.47 
 
 		 360 aa  54.3  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  29.37 
 
 		 343 aa  54.3  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  27.15 
 
 		 370 aa  53.9  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  30 
 
 		 343 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  24.81 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  26.79 
 
 		 372 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.59 
 
 		 395 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1696  hypothetical protein  28.29 
 
 		 403 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  24.91 
 
 		 457 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  26.49 
 
 		 375 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  21.3 
 
 		 389 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.15 
 
 		 377 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1200  pseudouridylate synthase  29.37 
 
 		 362 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00296391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.91 
 
 		 455 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.15 
 
 		 377 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  25.26 
 
 		 375 aa  51.6  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.97 
 
 		 377 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.97 
 
 		 377 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.55 
 
 		 455 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  28.48 
 
 		 357 aa  51.2  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  25.83 
 
 		 375 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  25.83 
 
 		 375 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  23.21 
 
 		 372 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  26.11 
 
 		 374 aa  50.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  23.21 
 
 		 372 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.48 
 
 		 354 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  30.07 
 
 		 359 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  26.49 
 
 		 360 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  23.16 
 
 		 389 aa  50.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.14 
 
 		 359 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  30.34 
 
 		 347 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  29.86 
 
 		 347 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.08 
 
 		 357 aa  48.9  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.97 
 
 		 388 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>