152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0756 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  100 
 
 		 402 aa  818    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  64.11 
 
 		 390 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  64.85 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  63.03 
 
 		 430 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  60.3 
 
 		 390 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  32.31 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  31.31 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.34 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  28.64 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  27.29 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.71 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.61 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  27.99 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  28.44 
 
 		 449 aa  153  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  28.3 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.38 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  31.4 
 
 		 423 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  27.38 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  28.64 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.48 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  24.82 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  27.34 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.57 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  26.47 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  28.97 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  25.25 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  26.96 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  26.18 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.05 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  25.99 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  25.19 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.2 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  28.62 
 
 		 745 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  29.35 
 
 		 863 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.69 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  25.8 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  25.99 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  27.27 
 
 		 652 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  25.59 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  25.54 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  24.09 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  25.6 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.96 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  25.09 
 
 		 680 aa  79.7  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  25.6 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  21.5 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  21.26 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.71 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  25.43 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  21.26 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  24.91 
 
 		 656 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.28 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.33 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  23.45 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  21.32 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.09 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  27.33 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2636  pseudouridylate synthase  23.48 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.79 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.33 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  22.51 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  31.77 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  34.64 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1249  pseudouridylate synthase  22.96 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883014  normal  0.601505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  27.49 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.14 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1148  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.24 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  21.2 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  28.98 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  23.66 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  22.03 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  24.37 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17440  tRNA pseudouridine synthase D  29.71 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  20 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  23.35 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1128  tRNA pseudouridine synthase D  23.45 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  29.89 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  20.87 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  24.51 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  22.98 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  23.41 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.46 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  30.46 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1696  hypothetical protein  22.74 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  23.35 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.47 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0925  pseudouridylate synthase  20.99 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3216  tRNA pseudouridine synthase D  28.9 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  25.32 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  27.91 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  27.91 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  27.91 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1513  tRNA pseudouridine synthase D  28.57 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1340  pseudouridylate synthase  22.81 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.185288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.91 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.73 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0967  tRNA pseudouridine synthase D  27.84 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3025  tRNA pseudouridine synthase D  23.77 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  27.84 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  26.74 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>