150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0774 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  100 
 
 		 374 aa  769    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  71.39 
 
 		 374 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  66.58 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  64.81 
 
 		 377 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  66.58 
 
 		 372 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  66.31 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  62.5 
 
 		 375 aa  498  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  52.88 
 
 		 365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  52.76 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  44.2 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  34.86 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.28 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  31.25 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.43 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1340  pseudouridylate synthase  35.79 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.185288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  32.23 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.71 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.4 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  28.19 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.73 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.97 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.17 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.8 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  28.53 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  30.26 
 
 		 399 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  29.95 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00167  tRNA pseudouridine synthase D  29.92 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  28.37 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  28.3 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1984  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.06 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2636  pseudouridylate synthase  29.35 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1128  tRNA pseudouridine synthase D  31.73 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  26.54 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1433  tRNA pseudouridine synthase D  28.49 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.733655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3025  tRNA pseudouridine synthase D  30.06 
 
 		 352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  30.32 
 
 		 350 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.49 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  28.18 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1499  tRNA pseudouridine synthase D  27.22 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  27.08 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  28.53 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  29.06 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1513  tRNA pseudouridine synthase D  30.4 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  26.91 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17440  tRNA pseudouridine synthase D  30.11 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38720  tRNA pseudouridine synthase D  30.73 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1619  tRNA pseudouridine synthase D  31.3 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  29.25 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1370  tRNA pseudouridine synthase D  29.78 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1173  tRNA pseudouridine synthase D  31.88 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1561  hypothetical protein  29.78 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1971  pseudouridylate synthase  27.07 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  28.03 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0828  tRNA pseudouridine synthase D  26.4 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.218757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4056  tRNA pseudouridine synthase D  32.19 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1148  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.37 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.63 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4158  tRNA pseudouridine synthase D  31.01 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  33.64 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1696  hypothetical protein  27.05 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  35.42 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  35.42 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  27.35 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0838  tRNA pseudouridine synthase D  33.65 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1249  pseudouridylate synthase  30.08 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.883014  normal  0.601505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3508  tRNA pseudouridine synthase D  26.33 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  27.79 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  27.03 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  26.69 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3346  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.53 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00141322  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  26.12 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.83 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  26.4 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  26.4 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1200  pseudouridylate synthase  27.73 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00296391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  28.77 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  30.6 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  32.23 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.68 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.22 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  26.68 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.22 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  25.71 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.22 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1074  hypothetical protein  27.55 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.22 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  25.33 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  27.6 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  25.33 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  25.33 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2883  tRNA pseudouridine synthase D  25.14 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  25.33 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0967  tRNA pseudouridine synthase D  25.14 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.77182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02595  tRNA pseudouridine synthase D  25.14 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0943  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.14 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336475  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3134  tRNA pseudouridine synthase D  24.8 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0800342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02560  hypothetical protein  25.14 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3046  tRNA pseudouridine synthase D  25.14 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.538175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0674  pseudouridylate synthase  25.92 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.305737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>