67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1152 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1152  tRNA pseudouridine synthase D TruD  100 
 
 		 377 aa  764    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  45.58 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  30.88 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.38 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.65 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  28.98 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  25.64 
 
 		 423 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.91 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  26.56 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  27.83 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.19 
 
 		 443 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  27.87 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.52 
 
 		 412 aa  109  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  28.95 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  26.68 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  27.07 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.69 
 
 		 402 aa  105  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  26.21 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.77 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  24.73 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  26.38 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  25.55 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  24.88 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  25.06 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.7 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.9 
 
 		 480 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  23.28 
 
 		 483 aa  94  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.45 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  24.02 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  23.15 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  26.42 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  24.94 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  29.37 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  23.1 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.31 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.36 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  29.2 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  30.17 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  29.32 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  28.93 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  27.68 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  26.34 
 
 		 863 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.43 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  26.56 
 
 		 680 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.18 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  24.82 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.82 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  24.46 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1148  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.73 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.41 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  20.92 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.07 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  23.28 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  24.47 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  29.49 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3346  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.11 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00141322  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  26.39 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  29.73 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.21 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  33.55 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  27.91 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.96 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  21.02 
 
 		 656 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  24.4 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  31.76 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  24.4 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  27.33 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>