152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1745 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  100 
 
 		 386 aa  785    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  42.64 
 
 		 395 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  38.72 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  33.16 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  32.65 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.27 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  32.14 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  29.49 
 
 		 389 aa  193  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.27 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.2 
 
 		 457 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.83 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.94 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  27.65 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  31.28 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  28.68 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  24.82 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  25 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  27.79 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.37 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  25.5 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.23 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.04 
 
 		 412 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  28.18 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  26.62 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  25.06 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  23.79 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  24.32 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  25.58 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  25.12 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.55 
 
 		 454 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.44 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0058  tRNA pseudouridine synthase D  34.21 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  31.76 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  24.29 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  24.78 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.74 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1593  hypothetical protein  31.08 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  34.55 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0869  tRNA pseudouridine synthase D  32.21 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  34.55 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  25.62 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03521  tRNA pseudouridine synthase D  32.68 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  31.08 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  24.25 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.36 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  23.31 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002512  tRNA pseudouridine 13 synthase  33.33 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18424  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  22.81 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  32 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  32.18 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0838  tRNA pseudouridine synthase D  31.54 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  24.08 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3429  tRNA pseudouridine synthase D  33.55 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3297  tRNA pseudouridine synthase D  33.55 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0962  tRNA pseudouridine synthase D  33.55 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  25.38 
 
 		 680 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1128  tRNA pseudouridine synthase D  34 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1984  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.12 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  28.06 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3351  tRNA pseudouridine synthase D  32.67 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0828  tRNA pseudouridine synthase D  34.21 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.218757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  31.85 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.16 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0674  pseudouridylate synthase  31.94 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.305737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  31.13 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3508  tRNA pseudouridine synthase D  33.77 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  23.02 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.82 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.27 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1619  tRNA pseudouridine synthase D  34.67 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1499  tRNA pseudouridine synthase D  30.2 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1119  pseudouridylate synthase  29.19 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.774647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1190  pseudouridylate synthase  29.19 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1835  tRNA pseudouridine synthase D  30.46 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  29.19 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4158  tRNA pseudouridine synthase D  34.67 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2753  pseudouridylate synthase  30.43 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  28.48 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  30.07 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1513  tRNA pseudouridine synthase D  31.54 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3859  pseudouridylate synthase  34.01 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.629248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1209  pseudouridylate synthase  30 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.269002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1173  tRNA pseudouridine synthase D  34 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  21.2 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.97 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0206  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  28.57 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0784918  normal  0.0319695 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.85 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  32.89 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1200  pseudouridylate synthase  27.88 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00296391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.37 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.37 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  26.4 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.37 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.37 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2510  tRNA pseudouridine synthase D  29.68 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  30.2 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  30.2 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  30.2 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  30.2 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>