More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5654 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 511 aa  1051    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  53.32 
 
 		 523 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  35.59 
 
 		 498 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  36.74 
 
 		 507 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  32.95 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  32.88 
 
 		 499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  30.64 
 
 		 531 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.22 
 
 		 494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.27 
 
 		 490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.5 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.2 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  35.38 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.48 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 594 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 531 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 500 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 488 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 493 aa  153  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 579 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 486 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  32.56 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 598 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  28.24 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.38 
 
 		 488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.34 
 
 		 481 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 576 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  29.42 
 
 		 582 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 592 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 503 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.57 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 506 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 483 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 557 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.07 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 508 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 561 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 592 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 514 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 555 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 601 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 540 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 498 aa  120  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 492 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 529 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.53 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  30.13 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 582 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.23 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>