254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2970 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 364 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  90.38 
 
 		 389 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  60.17 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  55.59 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  56 
 
 		 351 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  54.67 
 
 		 399 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  55.24 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  33.83 
 
 		 755 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.99 
 
 		 784 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 781 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  26.62 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.4 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.21 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  24.73 
 
 		 743 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  26.24 
 
 		 773 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  27.13 
 
 		 708 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 		 810 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 3145 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 632 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 566 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 		 786 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 828 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.75 
 
 		 799 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 878 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.69 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 955 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.14 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 873 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.19 
 
 		 638 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 1486 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 681 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 729 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 827 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1676 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  26.03 
 
 		 345 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 1297 aa  53.1  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.13 
 
 		 837 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 718 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 688 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 927 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 713 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 2262 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  28.65 
 
 		 475 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 515 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  24.05 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 767 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  27.52 
 
 		 604 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 634 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  25.16 
 
 		 623 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 1737 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 		 1014 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 1450 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.56 
 
 		 2240 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.24 
 
 		 864 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.98 
 
 		 594 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.23 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 934 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 886 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 613 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  26.72 
 
 		 690 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 589 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.22 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 689 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 632 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 968 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2664  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 187 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2283  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 186 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.976866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  26.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1138 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  26.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 638 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  26.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  26.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  26.9 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.33 
 
 		 884 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 3172 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.26 
 
 		 882 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 311 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  30.36 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 802 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.22 
 
 		 622 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 884 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>