More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3497 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  39.62 
 
 		 1060 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  39.48 
 
 		 1081 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  41 
 
 		 1122 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1036 aa  2124    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  41.83 
 
 		 1023 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  37.94 
 
 		 1177 aa  622  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  36.78 
 
 		 1066 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1066 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 1181 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1155 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1058 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1038 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1079 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1071 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 1029 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1161 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 1050 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 1071 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1008 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1079 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1037 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1114 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1006 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1173 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 1026 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1148 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1012 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1132 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1051 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1051 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1028 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1027 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 1023 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1124 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1128 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 1000 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1117 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1039 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 989 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1152 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 1038 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1082 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.18 
 
 		 1041 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 		 1155 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1039 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1023 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1010 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1116 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1064 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 1019 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 982 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1097 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1025 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 1140 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1147 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1096 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 979 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1062 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1023 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1006 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 986 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 1127 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1059 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 1128 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1033 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 1011 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1163 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1076 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1103 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1010 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 999 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  31.22 
 
 		 1047 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 994 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1175 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1076 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 1034 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 1189 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1172 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.75 
 
 		 1063 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1013 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1202 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1177 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1014 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1034 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1119 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1154 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1006 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1004 aa  409  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1075 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1084 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1076 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1036 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1041 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1087 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1043 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1154 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1042 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 1060 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 1077 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>