More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3258 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  39.62 
 
 		 1059 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  39.98 
 
 		 1143 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1070 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1099 aa  2220    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  36.25 
 
 		 1128 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 1110 aa  624  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1117 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1117 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1181 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1066 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1164 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 989 aa  420  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1037 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1155 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 982 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1053 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1161 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 1050 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1051 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1177 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1122 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1154 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1012 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1043 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1008 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1029 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1132 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1031 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1155 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1168 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1038 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1023 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1027 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1006 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 1026 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  30.67 
 
 		 1080 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1028 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1039 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1124 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1064 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 1128 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.35 
 
 		 1047 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 994 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1137 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1049 aa  376  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1077 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1152 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 996 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1071 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1076 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1020 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1060 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1006 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1026 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1043 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1085 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1096 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1080 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.44 
 
 		 1063 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 1025 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1097 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1082 aa  367  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1148 aa  367  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1051 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1079 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1130 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1031 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1006 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1128 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 1005 aa  363  6e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1071 aa  364  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1052 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  28.71 
 
 		 1035 aa  363  9e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1039 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1000 aa  363  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1076 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 996 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1119 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1071 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1034 aa  361  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1014 aa  360  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1076 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1173 aa  357  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1010 aa  357  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1129 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1102 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1192 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1127 aa  354  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.68 
 
 		 1043 aa  353  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1120 aa  353  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1038 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1116 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1017 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1189 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1023 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 1033 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1008 aa  350  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1172 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1063 aa  350  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 1020 aa  350  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>