121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1797 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  60.75 
 
 
1225 aa  1370    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  57.62 
 
 
1236 aa  1339    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  52.09 
 
 
1193 aa  1112    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  57.54 
 
 
1208 aa  1295    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  79.04 
 
 
1228 aa  1874    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 
1246 aa  2503    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  62.14 
 
 
1192 aa  1379    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  45.94 
 
 
1114 aa  873    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  61.33 
 
 
1170 aa  1348    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  57.35 
 
 
1226 aa  1297    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  47.38 
 
 
1189 aa  937    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  34.39 
 
 
1183 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  33.25 
 
 
1203 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  33.64 
 
 
1208 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  33.57 
 
 
1109 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  33.72 
 
 
1129 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  33.12 
 
 
1127 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  35.31 
 
 
1120 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  34.93 
 
 
1098 aa  492  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  32.72 
 
 
1113 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  32.61 
 
 
1172 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  31.86 
 
 
1166 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  31.99 
 
 
1161 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  32.97 
 
 
1098 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  30.8 
 
 
1088 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  32.06 
 
 
1126 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  30.71 
 
 
1107 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.07 
 
 
593 aa  214  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  33.39 
 
 
593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  30.18 
 
 
604 aa  194  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  30.79 
 
 
583 aa  194  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  30.19 
 
 
649 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  32.73 
 
 
604 aa  185  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.62 
 
 
546 aa  178  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  29.48 
 
 
556 aa  178  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.31 
 
 
1066 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.97 
 
 
573 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  30.53 
 
 
562 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.27 
 
 
551 aa  161  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.21 
 
 
596 aa  157  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  29.87 
 
 
577 aa  154  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.92 
 
 
574 aa  151  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  30.24 
 
 
569 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  30.17 
 
 
803 aa  149  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  28.06 
 
 
574 aa  141  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.21 
 
 
600 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.72 
 
 
737 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  29.69 
 
 
566 aa  139  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
1127 aa  131  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.74 
 
 
585 aa  122  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.85 
 
 
585 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  27.19 
 
 
951 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  23.83 
 
 
1575 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.91 
 
 
1040 aa  112  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.33 
 
 
573 aa  112  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.04 
 
 
521 aa  92.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  29.91 
 
 
655 aa  90.9  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.54 
 
 
691 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.47 
 
 
668 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.56 
 
 
554 aa  89.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.44 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.63 
 
 
657 aa  84.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  25.57 
 
 
655 aa  84.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  26.95 
 
 
878 aa  82.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.7 
 
 
681 aa  81.6  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.17 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.21 
 
 
453 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23 
 
 
638 aa  76.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.13 
 
 
658 aa  75.1  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.77 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  25.48 
 
 
730 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.18 
 
 
655 aa  70.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  24.66 
 
 
1838 aa  68.9  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.45 
 
 
8871 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  29.13 
 
 
685 aa  65.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.64 
 
 
455 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  29.13 
 
 
685 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.24 
 
 
1113 aa  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
1184 aa  63.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  26.61 
 
 
566 aa  62.4  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  24.3 
 
 
447 aa  60.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.91 
 
 
1126 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.18 
 
 
616 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  23.05 
 
 
667 aa  59.7  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 
1138 aa  60.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  25 
 
 
646 aa  58.9  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.27 
 
 
1275 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.91 
 
 
3197 aa  56.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.76 
 
 
645 aa  55.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.83 
 
 
2807 aa  55.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  23.78 
 
 
1124 aa  55.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.99 
 
 
1019 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  24.9 
 
 
3197 aa  54.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.56 
 
 
645 aa  53.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27 
 
 
1118 aa  54.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  34.38 
 
 
1133 aa  53.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  31.96 
 
 
590 aa  53.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.45 
 
 
677 aa  53.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.6 
 
 
1490 aa  52.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.35 
 
 
1340 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>